第二次是皮斯克发现了灰原变小的事情,一旦皮斯克将灰原交给组织,哪怕没有抓住灰原,只是把宫野志保变成了小学生灰原哀这件事告诉组织,那柯南也会陷入危险中。然而,就是这么一个能抓住灰原的能人,却被琴酒认定为废物,然后处决。如果皮斯克没死,灰原变成小学生的事情会暴露,灰原身边的小学生们也会遭到怀疑。按着组织的性子,可能直接全部处决。即使组织还留有人性,会放过无辜的人。但灰原也说过,自己叛逆组织后,又自己修改的工藤新一死亡一定会引起组织的怀疑,反而会加重组织的疑心,再联想到工藤新一和宫野志保一样变小了。那么江户川柯南身份暴露也只是时间问题了。